Journal of Hepatology上发表的一项研究表明，肝硬化患者的腹腔疾病发病率是普通人群的两倍以上。这些患者食用无麸质饮食可以改善他们的肝脏健康状况，从而改善肝硬化的预后。
该研究的作者强调，所有被诊断为肝硬化的患者都应该接受乳糜泻筛查，因为无麸质饮食是改善肝硬化预后的一种安全有效的方法。肝硬化是由多种因素引起的，高酒精摄入量和乙型肝炎或丙型肝炎是最常见的原因。乳糜泻可能会加速由这些因素引起的肝脏健康恶化。
乳糜泻是一种自身免疫性疾病。乳糜泻患者摄入麸质时，他们的免疫系统会他们的小肠。肠道的慢性炎症会损害营养吸收并导致许多营养缺乏。最常见的营养缺乏是铁、钙、维生素D和其他脂溶性维生素（A、E和K）和必需脂肪酸缺乏。
乳糜泻患者更可能发生自身免疫性肝病，如自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化和原发性硬化性胆管炎。有趣的是，乳糜泻患者常见血液检查中肝酶水平升高，脂肪肝疾病的患病率增加。因此，研究人员定期对所有乳糜泻患者进行肝功能检查。越早发现异常，越早制定治疗方案，效果越好。
在所有自身免疫病症中存在不同程度的肠渗透性过高，尤其是未确诊的乳糜泻。当废物、毒素和细菌通过肠壁渗漏时，它们会直达肝脏。肝门静脉收集来自腹腔、内脏的血液，其中包含从胃肠道吸收的营养物质，在肝脏内进行加工、贮存或转运。肝脏可以捕捉任何可能通过肠道逃逸的细菌或异物，防止它们扩散到身体的其他部位。谷氨酰胺是一种有效的降低肠道通透性的药物，有助于愈合和密封肠壁。
如果肠道内存在有害物质和渗漏，肝脏很快就会变得不堪重负。肝脏中的Kupffer细胞是一种称为巨噬细胞的白细胞，可以异物。巨噬细胞中含有一种酶，使它们能够消化它们的碎片或毒素。
如果肠道渗漏，高浓度的废物会到达肝引发肝脏内的大量炎症。从肠道到肝脏的最有害物质之一是脂多糖——一种内毒素，存在于肠道中的革兰氏阴性细菌的细胞壁中。如果肠道中的有害细菌过度生长，而且肠道渗漏，那么高浓度的内毒素会一直到达肝脏。
内毒素刺激Kupffer细胞产生高水平的炎症化学物质，称为细胞因子，如白细胞介素6（IL-6）和肿瘤坏死因子α。通常情况下，肝脏会发生炎症，并开始产生高水平的称为超氧化物的基。这些具有高度的性，可以加速由酒精、药物、病毒和其他毒素引起的肝损伤，而水飞蓟有助于减少肝脏中Kupffer细胞产生的炎性细胞因子。
