妇产科医院的前身西门妇孺医院是一所美国基督教会主办的教会医院。1884年6月由美国人玛格丽特.威廉逊（Margaret.Willianson）女士捐款5000美元，在上海西门外租房两间，创办门诊部，规模很小。为纪念威廉逊女士便将医院命名玛格丽特.威廉逊医院，中文名为“上海西门妇孺医院”，此为沪上首家妇孺医院。后由美籍女医师爱.罗夫奈德（Elizabeth Reifanyder）发扬光大。1952年1月，为了教学医疗之需要, 以上海西门妇孺医院为主体，将红十字会第一医院（今华山医院）的妇产科及中山医院的妇产科合并为上海医学院妇产科学院.同年7月，由华东军政委员会卫生部接管。1985年更名上海医科大学附属妇产科医院.1992年批准成为上海市红十字妇产科医院，同年被卫生部、世界卫生组织联合国儿童基金会首批命名为”爱婴医院”,1995年获三级甲等专科医院称号.2000年4月更名复旦大学附属妇产科医院. 2003年5月上海市卫生局批准上海市红房子妇产科医院为医院的第二冠名。
新中国成立以来，妇产科医院得到极大发展与进步。建国初，医院床位268张，职工245名，年门诊量63135人次,住院病人5151人次。至2003年12月统计,病床370张,医院有职工663名，其中正副教授52名名，年门诊量389278人次，年住院病人11748人次；现在医院占地面积1.2万平方米，建筑面积2.1万平方米；固定资产3250多万元；万元以上设备195台，其中包括全套妇科内窥镜、自动生化分析仪、三维彩色多普勒诊断仪、超声骨密度仪、800毫安西门子X光机、电视腹腔镜等医疗仪器设
