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1、创办不同：SCI由美国科学信息研究所在美国费城创办，是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库；EI是由美国工程师学会联合会于1884年创办的历史上最悠久的一部大型综合性检索工具。
2、作用不同：SCI的作用是进行科学统计与科学评价；EI的作用是是供查阅工程技术领域文献的综合性情报检索刊物。
3、属性不同：SCI偏向于自然科学、生物、医学类的，而EI偏向于机械工程、机电工程、船舶工程、制造技术等。
4、出版时间不同：SCI每年出六期，现每期有 A、B、C、D、E、F六册；EI每月出版1期。
