如何用Pubmed设计qPCR引物?实验时间

作者:  时间:2018-12-07  热度:

  今天准备跟大家分享一下 qPCR 引物设计的具体流程。在进行引物设计之前,首先大家都应该了解引物设计需要注意的一些细节与原则,归纳如下:

  1. 要设计引物首先要找到 DNA 序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构,就要避开它。如这一段不能形成二级结构,那就可以在这一区域设计引物。

  11. 引物的 3 端要与模板严格配对,而 5 端碱基没有严格的限制,只要与模板 DNA 结合的部分足够长,其 5 端碱基可不与模板 DNA 配对而呈游离状态,这样,我们可以在引物的 5 末端加上酶切位点(引入酶切位点时,要考虑到进行双酶切的共用缓冲液,否则给下游工作带来困难)、启动子,方便下游操作。

  了解了设计原则,接下来我们就看看具体的设计流程,本次讲解应用 pubmed 来设计。比如我们要设计小鼠源性白介素 4(IL-4) 的引物。

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